وخلاصة القول كان الأمام جعفر الصادق يدرك تماما ان الافكار العلمية لا يمكن ان تشرق وتكون مقبولة لطلاب العلم الا عن طريق المنهج العلمي التجريبي، ولا يخفي على القارىء ان الامام جعفر الصادق كان فقيها وعالما كبيرا متميزا في معظم فروع المعرفة، لذا نستطيع القول ان اطلاعه واسعا وعلمه غزيرا، وكما أن الاحترام والتقدير متبادل بينه وبين تلميذه العبقري جابر بن حيان الازدي.
ويذكر لنا محمد يحيى الهاشمي في كتابه الكيمياء في التفكير الاسلامي نقلا عن جابر بن حيان من كتابه (الرحمة) ما نصه قال لي سيدي (الامام جعفر الصادق) يا جابر، فقلت لبيك ياسيدي، فقال هذه الكتب التي صنفتها جميعها، وذكر فيها الصنعة (علم الكيمياء) وفصلتها فصولا، وذكرت فيها من المذاهب وآراء الناس، وذكرت الابواب وخصصت كل كتاب.. وبعيد ان يخلص منها شيء الا الواصل، والواصل على غير محتاج الى كتبك، ثم وصفت كتبا كثيرة في المعادن والعقاقير، فتحير الطلاب وضيعوا الاموال، وكل ذلك من قبلك... والآن يا جابر استغفر الله، وأرشدهم الى عمل قريب سهل، تكفر به ما تقدم لك واضح.
بعد ما تقدم اخذ جابر بن حيان الازدي يفكر وبعمق شديد بما كان يقوله الامام جعفر الصادق الذي كان يحث وبشدة على التجارب العلمية والمشاهدات الحسية وعدم الاكتفاء بالتحليلات الفكرية خاصة في حقل علم الكيمياء، لذا وجد جابر بن حيان نفسه امام الاستاذ العالم العملاق الامام جعفر الصادق الذي لابد ان ينفذ جميع اقتراحاته ونصائحه الثمينة.
ينقل محمد يحيى هاشم في كتابه السابق نصائح الامام جعفر الصادق إلى جابر بن حيان الأزدي ما نصه، فقلت يا سيدي اشر على اي الباب اذكر، فقال: ما رأيت لك بابا تاما مفرد إلا رموزا مدغما في جميع كتبك، مكتوما فيها، فقلت له : ذكرت في السبعين وأشرت اليه في كتب النظم، وفي كتاب الملك من الخمسمائة، وفي كتاب صبغة الكون، وفي كتب كثيرة من المائة ونيف، فقال صحيح ما ذكرته من ذلك في اكثر كتبك وهي في الجمل مذكور، غير أنه مدعم مخلوط بغيره، لا يفهمه إلا الواصل، والواصل مستغن عن ذلك. ولكن يا جابر، أفرد فيه كتابا بالغا بلا رمز واختصر كثرة الكلام بما تضيف إليه كعادتك، فإذا تم فاعرضه علي فقلت السمع والطاعة.
والسبب الذي دفع الأمام جعفر الصادق الى نصح جابر بن حيان الأزدي ان كتب علم الكيماء آنذاك كانت مملؤة بالرموز المدغمة الصماء، لذا رأى الأمام جعفر الصادق أن جابر بن حيان نابغة في هذا المجال الحيوي ويستطيع ان يحلل هذه الألغاز ويجعلها في متناول طلاب العلم بدون عناء، وهذا يثبت بما لا يقبل الشك أن الامام جعفر الصادق كان خبيرا في علم الكيمياء، لأنه طلب من جابر بن حيان مؤسس علم الكيمياء الحديثة ان يطلب على ما يدونه في هذا المجال الحيوي.
