بدأ التعليم الاهلي في محافظة الاحساء عن طريق الكتاتيب او المطوع، وهو الذي يقوم بتعليم القرآن الكريم والحديث الشريف واللغة العربية، وهي من اوائل مدن المملكة التي افتتحت وانشئت مدرسة اهلية مطورة عام 1343هـ، حيث افتتح الشيخ حمد محمد النعيم هذه المدرسة، وسميت بمدرسة النجاح وفي عام 1348هـ زار الملك عبدالعزيز (طيب الله ثراه) المدرسة، واطلع على سير الدراسة بها، واعجب بنظامها، فطلب من الأهالي افتتاح مدرسة على منوالها. وهكذا استمرت مسيرة التعليم الاهلي في المحافظة، واصبحت رافدا من روافد التعليم كسائر مناطق ومحافظات المملكة.
وفي عام 1399هـ افتتحت مدارس الخالدية الأهلية تحت اشراف وزارة المعارف - آنذاك ـ بعد صدور الائحة التنظيمية للمدارس الأهلية. وقد توالى فتح المدارس الأهلية، وكانت تحت اشراف قسم تعليم الكبار، وفي عام 1418هـ تم انشاء اقسام التعليم الأهلي بمناطق ومحافظات المملكة تقوم بالاشراف والمتابعة للمدارس والمعاهد الأهلية.
وتقدم وزارة التربية والتعليم الدعم المادي للمدارس الأهلية (الاعانة السنوية) وكذلك تكرم المدارس الأهلية المتميزة، في لقاء يعد عرسا من أعراس التعليم، وهو تجمع ملاك المدارس الأهلية في لقاء مع القائمين على التعليم في المملكة.
وبلغ مجموع المدارس الأهلية بالمحافظة في العام الدراسي الحالي 5 مدارس تضم 13 مرحلة دراسية من ابتدائي ومتوسط وثانوي، حيث كان عدد طلاب المدارس الأهلية عام 1399 65 طالبا وبلغ عام 1424هـ 2917 طالبا تقريبا.
والمدارس هي : الخالدية (ابتدائي)، الأنجال (ابتدائي ومتوسط وثانوي)، دار العلوم (ابتدائي ومتوسط وثانوي)، الشروق (ابتدائي ومتوسط وثانوي)ـ الكفاح (ابتدائي ومتوسط وثانوي).
وتنفيذا للتوجيهات الكريمة بتوطين الكفاءات السعودية في المدارس الاهلية بلغت نسبة سعودة الاداريين 80% تقريبا ونسبة المعلمين السعوديين من مجموع معلمي المدارس الأهلية 19.28% تقريبا.
اما قسم التعليم الاهلي بالمحافظة فيقدم جميع الخدمات للمدارس الاهلية، بالتنسيق مع جميع الادارات والوحدات والاقسام بالادارة، وبعض الدوائر الحكومية التي لها علاقة بالمدارس الاهلية. ويقوم بالاشراف والمتابعة وكذلك بتقديم البرامج والدورات التطويرية لمنسوبي المدارس الأهلية، من اداريين ومعلمين وفنيين، وكذلك تذليل جميع الصعوبات التي تواجه ملاك المدارس الاهلية.
كما يشرف قسم التعليم الاهلي على معاهد اللغات بالمحافظة (بنين) وعددها 6 معاهد لغات أهلية.
