من جهة أخرى، التقى العيسى في العاصمة المغربية بوزير الشؤون الخارجية والتعاون الدولي في المملكة المغربية الأستاذ ناصر بوريطة، وجرى خلال اللقاء بحث الموضوعات ذات الاهتمام المشترك.
إلى ذلك التقى د. العيسى بوزير العدل والحريات المغربي محمد أوجار، وبحث معه عدداً من الموضوعات ذات العلاقة بمفاهيم وضوابط الحريات وصلتها بالخطاب الفكري. واجتمع د. العيسى مع وزير الأوقاف والشؤون الإسلامية المغربي السيد أحمد التوفيق، وبحث معه مجالات التنسيق والتعاون المشترك مستعرضين آفاق الأطر الشرعية والفكرية لخطاب الاعتدال الإسلامي.
وعقد د. العيسى لقاءات مع عدد من كبارعلماء ومفكري المغرب، دار خلالها استعراض سبل التعاون والتبادل، وبخاصة فيما يتعلق بالجاليات الإسلامية في بلاد المهجر بمختلف أصولهم وخلفياتهم، وضرورة تعزيز نشر الوعي الديني والفكري بينهم، بما يعكس القيم العليا لدين الإسلام، واستمرار تحصينهم ضد مخاطر تسلل الأفكار المتشددة والمتطرفة والإرهابية.